If you don’t mind は 「もし気にしないんだったら」という意味です。ですから、If you don’t mind it being far... は 遠いですが、気にしないんだったら...という意味になります。
例えば 「少し遠くてもよろしければ、いい場所があります」を言いたいなら、 I know a good place, if you don’t mind it being far.
とか I know a good place. It’s a little far if you don’t mind.
と言うこともできます。