本当なら〜出来ないのにって英語でなんて言うの？

In theory it was impossible, but miraculously, I made it.
【訳】理論上は不可能だけど、奇跡的に、私できたんです。

In theoryで「理論上は」です。
I made itは、そのまま訳すと「私はそれを作った」ですが、「やった」「できた」「成功した」という意味で単体でもよく使われます。
miraculouslyは「奇跡的に」の直訳ですが、個人的には、書くことはあっても話す時には使っていません。舌を噛みそうなので（笑）
次の例のように別文で It was a miracleにしてしまいます。

It is unbelievable, but I did it. It was a miracle.
【訳】信じられないことだけど、私やりました。奇跡です。

It shouldn’t have happened, but it actually did.
【訳】起こるはずのないことだけど、実際起こったんです。

suppose toは確かに少し柔らかい感じがしますが、私はshouldはこういう形で使えるんじゃないかなと思います。

ご参考になれば。