薬がどうやって効くのか、が面白そうだと思って。って英語でなんて言うの？

I'm interested in ～ は「～に興味をもつ」「～が面白いと思う」、work はここでは「（薬として）働く＝作用する、効く」となります。 「どう～するか」には how 節を使います。 また「どうやって効くか」は mechanism でも表すことができます。 直訳でいうと、前者は「薬がどう作用するか」、後者は「薬の仕組み」という違いになります。