If possible, please obtain Phytosanitary Certificate. However, in case you cannot, it is still acceptable.
証明書は第三者（公的機関？）から取得（obtain/get）するものだと思いますので、
「付けてください」は Please obtain 〜 となります。
「無くても」は取得できない（cannot obtain）場合になるので、in case you cannot obtain it (=PC) ですが、前半の obtain PC と重複するので cannot まででいいです。
「大丈夫です」はPCなしでも品物を受け入れる（acceptable）という意味なので、it is acceptable です。
「最悪」は in the worst case などと言わなくても、「それでも」の still を acceptable の前に置けば表すことができます。
日本 
