Farmers are facing a crisis due to little rainfall
Farmers = 農家
Facing a = 直面する
Crisis = 大問題/ 危機
Little rainfall = 少雨量
Be in trouble はこの、シチュエーションに使うとちょっと変です。 “be troubled by” (困っている) や、もう少し深刻な問題なら “crisis” を使うべきです。
Farmers are troubled by the lack of rainfall = 農家は雨不足の原因で困っている。
Farmers are in a crisis due to little rainfall = 農家は少雨量の原因で危機を直面している。