If you just want to study English, you can do that in Japan, too.
If you just want to study English, you don't have to leave Japan.
If ...just want to 〜、というと、「もし、…が〜したいだけなら、」という意味になります。
なので、
If you just want to study English, が、
「もし君が英語を勉強したいだけなら」 という意味になります。
その続きですが、
you can do that in Japan, too. は、
「日本でもそれはできる」です。
you don't have to leave Japan. は、
「日本を離れなくてもいい」です。
日本 
