Please make it easy for users to navigate themselves.
「直感的」の意味を、「ユーザーが自分で自分を導くことができる」とします。
『ナビ』は日本語にもなっていますが
"navigate" は「操作する、導いていく」の意味です。
Please make it easy for users to navigate themselves.
直訳すると
「それ(ウェブサイトデザイン)をユーザーにとって自らを導きやすくしてください。」
つまり
「直感で操作できるものにしてください」
と、なります。