The seats at the counter on the left/right are available.
①There (is an open seat/are open seats) at the other counter.
→ もうひとつのカウンターの席(1つ/複数の)方が空いています。
②The seats at the counter on the left/right are available.
→左/右側のカウンターの方が空いています。
You can have a seat at the other end of the counter.
There are a few seats available on the opposite end of the counter.
この場合、次のような言い方ができますよ。
ーYou can have a seat at the other end of the counter.
「カウンターの反対側の席にどうぞ」
at the other end of the counter 「カウンターの反対側」と言えます。
ーThere are a few seats available on the opposite end of the counter.
「カウンターの反対側が数席空いてますよ」
on the opposite end of the counter でも「カウンターの反対側」と言えます。
ご参考まで!