日本語で言うテーマは英語では「topics」を使います。
テーマは「theme」（正しい発音は：thイーム）から由来していますが、日本語だと意味が広げてあります。。。と言うと、英語での「theme」は環境に関する事に限定して使います。
例えば、西洋風のインテリアデザインなら「The interior design uses a Western theme」とか、「The theme of the story」（物語の主題）などと、日本語とはちょっと違う使い方をしています。
したがって、「What topics do you have in your classes?」を提案しました。
授業の課題はほとんどの場合「topic」と言います。
・What topic are you covering in your class?
「あなたのクラスでは、何をテーマとして扱っているの？」
・What theme is your class focusing on?
「あなたのクラスではどんなテーマ（内容）を扱っているの？」
cover a topic で「（テーマや話題を）扱う・カバーする」という意味になります。
他には：
What kind of subject matter are you guys studying in your class?
「そっちのクラスではどんな主題・テーマを勉強しているの？」
ご質問ありがとうございました。
お役に立てれば幸いです。
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