診断書を医師にこれから書いてもらいますって英語でなんて言うの？

医師の診断書は、doctor's note ということが多いと思います。

I am going to ask the doctor to write your doctor's note.
（お医者さんに、あなたの診断書を書いてもらうようにしますね。）
という表現になります。御参考になさってください。

The doctor will be writing your medical certificate.
So please wait a while.
お医者さまがこれから診断書を書きますので、少々お待ち下さい。

この文は会話での文章です。ライティングの文章になるとsoは文章の始めにつけないでくださいね。

参考になれば幸いです。