It's 500 yen for three hours, so if you don't stay for the whole three hours it's a waste.
It's a flat rate of 500 yen for three hours, so you should stay for the whole three hours otherwise you don't get your money's worth.
◯時間◯円って決まってると、時間いっぱいいっぱいまでいたくなっちゃいますよね！
1) It's 500 yen for three hours, so if you don't stay for the whole three hours it's a waste.
「３時間５００円だから、３時間いないともったいないよ。」
「３時間５００円」は 500 yen for three hours
It's a waste. で「もったいないよ」という言い方。
2) It's a flat rate of 500 yen for three hours, so you should stay for the whole three hours otherwise you don't get your money's worth.
「３時間５００円の均一料金だから、３時間ずっといないと元を取れないよ。」
a flat rate は「均一料金・定額制」
get one's money's worth は「（払った分の）元を取る」という意味です。
ご参考になれば幸いです！
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