胃腸を休ませるって英語でなんて言うの？

こう言えますよ、

❶I’m going to do a short fast to reset my gut.
(胃腸をリセットするために プチ断食をします)。
〜という言い方をよくします。

❷I’m going to do a short fast to give my stomach a break.
(胃腸を休ませるために、プチ断食をします)。

Fast 断食
Short fast プチ断食
Stomach /gut 胃腸

参考に！

休ませることは「Rest」すると言います。

また、胃腸は「Stomach」でいいと思います。こちらがカジュアルな言い方で、「Intestines」が医学的名称です。

また、よりカジュアルな言い方をするなら「Rest my tummy」でもいいです。

おっしゃられている内容は、rest one's stomach and intestinesと言います(^_^)
restが「休ませる」
stomachが「胃」
intestinesが「腸」
です。
例）
Rest your stomach and intestines
「胃腸を休ませなさい」

以上です。
少しでも参考になれば幸いです(^_^)