「見ることができてますか？」（通話の状態などによっては見えないことがあるので）という意味であればcanを使ってもいいと思います。
また不具合があったりといろいろ試していて、「今は見える？」と聞く時は最後にnow?を足すといいと思います。
その他参考：
Do you see what I'm doing right now?
私が今何しているか見えますか？
Do you see my face?
私の顔が見えますか？
ご質問ありがとうございます。
「私のこと見えてますか」はCan you see me?とDo you see me?です。ビデオ通話で特別にAm I visible?とIs the video working?も使えます。
例文：I can't see you. Can you see me? Is your video working?
ご参考になれば幸いです。
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