How long have you had your pollen allergy symptoms?
How long have you been suffering from your hay fever symptoms?
ある過去の時点から現在まで続いているわけですから、現在完了形を使って表現してあげます。
1) How long have you had your pollen allergy symptoms?
2) How long have you been suffering from your hay fever symptoms?
「どれくらい続いていますか?」は
How long have you ...? の形を使って表現します。
「花粉症の症状」は pollen allergy symptoms や hay fever symptoms と言えます。
ご参考になれば幸いです!