「〜もあります」は there are ... を使って表現できます。
この場合「〜の場合もあります」と言っているので
There are times when ... を使って言うと良いでしょう。
There are times when a warranty is not effective.
「保証が有効でない場合もあります。」
There are times when a warranty does not cover certain things.
「保証が特定のものを補償しない場合もあります。」
warranty で「保証・保証書」
effective で「効力のある・有効な」
cover で「費用や損害を補償する・まかなう」
ご参考になれば幸いです!