質問ありがとうございます。この場合は 過去形の方がいいです。
例えば、「そうだったんだ」と言いたい時は、
So that’s what you meant.
(あ〜そういう意味だったんだ)。
So that’s what it was about.
(あー、そういうことだったんだ)。
So that’s why.
(あーだからなんでね)。と言えます。
「あー、あなたそう思ってたんだ」は、
So that’s what you thought.
「あー、あなた知ってたんだ」は、
So you knew. です。
So は 「あー」や「へぇー」というようなニュアンスです。
参考になれば嬉しいです!