I would like to unify security design in the whole of the buildingでしょうか? in the whole buildingで良いのでしょうか?
そうですね。
私もこういう風に訳せばいいと思います。
ただ security design を(the)で特定する必要があります。
それ以外は何も変わらないです。
Nice work!
例文 The foreign policy of the government should be unified.
「政府の外交政策が統一すればいいです。」
参考になれば幸いです。