はっきりと、明確に、クリアにしてくださいというのであれば Can you make it clear? と言います。Can you make it clear who will be in charge of the project? というと「誰がプロジェクトの責任者になるのかはっきりさせてくれますか?」となります。上司なのでより丁寧に言いたければ Would you please make it clear のようにします。
また、「決断してください」とか「決めてください」であれば Can you make a decision? とか Would you be able to decide soon who will be in charge? 「誰が責任者になるのかなるべく早く決めていただけますか?」という言い方もあります。ご参考に。