estimateは見積り、概算するという意味ですので、We estimate the 50 working hours.で、｢作業時間は50時間と見積もっております。｣となります。
また、it takes ～ hoursで、～時間掛かるという表現になりますので、We think it will take 50 hours.で、｢50時間掛かると思います。｣となります。
We estimated that it will take 50 hours when we calculated the amount of work that needs to be completed.
We estimated that it will take 50 hours when we calculated the amount of work that needs to be completed. はこの見積もりでは50時間を想定しています。と言う意味です。
estimated =想定した
it will take 50 hours は50時間かかると言う意味です。
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