最初の言い方は、We made something by putting everything together. は、みんなで力を合わせて1つの物を作り上げた。と言う意味として使われていました。
最初の言い方では、made something は、作り上げたと言う意味として使われています。putting everything は、力を合わせてと言う意味として使われていました。
二つ目の言い方は、We made one item by working together. は、みんなで力を合わせて1つの物を作り上げた。と言う意味として使われています。
二つ目の言い方では、working together は、力を合わせてと言う意味として使われていました。
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work together（一緒に働く/協力する）や combine our efforts（私たちの努力を合わせる）という表現を使います。
We all worked together to create one thing. シンプルでわかりやすい表現です。「みんな（We all）が協力して（worked together）、一つのもの（one thing）を作り上げた（create）」という意味です。
We combined our efforts to build something. combine our efforts は「各自の努力を結集する」という、より強調された表現です。build something（何かを築き上げる）は、文化祭の出し物など、具体的な成果物を作る場合によく合います。
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