It's possible that my training method wasn't right.
こんにちは。
ご質問ありがとうございます。
*I might have worked out in the wrong way.* ➔ 完璧です！
他にも使える文章：
"Maybe I did it wrong."＝「間違えたかもしれない。」
"It's possible that my training method wasn't right."＝「トレーニングの仕方が間違っていた可能性がある。」
ご参考までに。
I might have worked my muscles out in the wrong way.
ご質問ありがとうございます。
おっしゃったように「I might have worked out in the wrong way.」はほとんどいいです。ちょっと不自然ですが、相手に伝わるかもしれません。
もっと具体的に言った方がいいです。その場合では「I might have worked my muscles out in the wrong way.」になります。
しかし、一番的確な言い方は「I might have worked out improperly.」だと思います。
ご参考になれば幸いです。
アメリカ合衆国 
