こんにちは！
ご質問ありがとうございます。
ご質問について、いくつか言い方が考えられますが、例えば、
Despite not knowing exactly what the dog is thinking or feeling, we have to trust that we're giving him the best possible treatment based on what we think is right.
として、『彼が本当は何を思っているかわからないけれど、私たちがよいと思った最善の治療をしていると信じるしかない。』とするのはいかがでしょうか。
役に立ちそうな単語とフレーズ
trust 信じて受け入れる、信頼する、信用する
best possible 最高・最善・最良の
despite ～にもかかわらず、～をよそに
参考になれば幸いです。
日本 
