当然のことをしただけです。って英語でなんて言うの？

この３つの例文はいかがでしょうか。日常に見聞きする言い方ですよ。

I just did the right thing. 　
当然のことをしたまでです。（自分にとって「正しい」こと）

It was an obvious thing to do.
当たり前にやるべきことでした。

I didn’t do anything special.
何も特別なことはしていません。

言い回しとして「当然のことをしただけ」と言いたい場合は
I just did the right thing.

が一番近いかもしれません。この場合のrightは自分が正しいと判断したというよりも「普通そうするよね」というような常識に基づいた判断をしたということだからです。
軽く照れてる感じが出るのは

It's nothing special.

かもしれません。お礼を言われるようなことはしていませんよーという感じの気がします。

Don't mention it = 礼は要らない

言い方によっては少しかっこつけた感じに聞こえます。

A: I'm so grateful you came early! (早く来てくれて本当に助かるわ！)
B: Don't mention it. (何て事ないさ)

と言ったように使います。

Oh, it's nothing = そんなの大した事ないさ

最初のohを付けると「そんなのも気にもとめなかった」なニュアンスが加わります。日本語で言うと「あらあ」とか「ああ」に当たります。

「自分がやるべきことをしたまでだよ」の意味です(^^♪

このwhatは関係代名詞のwhat、
be supposed to は「することになっている、当然することが求められている」といった意味です(^^♪

少し長めですが、日常的に使う範囲だと思います(^_^)