As stipulated in the contract, we are unable to transport items that cannot be packaged.
In accordance with the contract, we are unable to transport items that cannot be packaged.
英訳1：stipulated は「規定された」という意味。as stipulated in the contract で「契約書の記載通りに」となります。
items that cannot be packaged で「荷造りできていないもの」。items は受け身で言うのが自然です。
英訳2：accordance は「一致」という意味ですが、in accordance with ~ で「〜に従って」という慣用表現になり、in accordance with the contract で「契約書の記載通りに」。
丁寧な言い方をするなら、unfortunately「あいにく」をつけるといいでしょう。
たとえば、
We are unfortunately unable to transport ~「申し訳ありませんが、〜はお運びできません」
As mentioned in the contract, we are unable to deliver the items that are not packed.
契約書に記載されているように、荷造りのされていないお荷物はお運びできません。
As mentioned..., ...に書かれている通り、
we are unable to ... ; ...できかねます。
As mentioned before, our service is limited to the packed items.
先程申し上げた通り、我々のサービスは荷造りされたお荷物に限られます。
アメリカ合衆国 
日本 
