良い悪いは別にしてって英語でなんて言うの？

これは、whether A or B, ~ という形で表現出来ます。

例文は、そのまま「よかろうが、悪かろうが、彼はそれをしたかっただけだ」です。

もう一つ例文を書きますと
Whether positive or negative, change can be stressful to many people.
(よい意味でも悪い意味でも、変化というものは、多くの人にとってストレスになりうる）

can　ありうる

ご参考まで。

加筆ですが、いくつか違う言い方もあるので、参考までに！

①Right or wrong aside, ...
いい悪いは置いといて…

②Never mind if it was right or wrong, ...
いい悪いはこの際考えないで…

という感じです。

意味合いはほぼ同じなので、言いやすい方をぜひ使ってみてください！

お役に立てれば幸いです！