If the numbers on the sales slip and the report don't match make sure you call your superior immediately.
If the numbers on the sales slip and the report don't match be sure to call your superior right away.
こういう場合には"make sure you +(動詞)" 又は "be sure to +(動詞)" は 'must'
のようなニュアンスで「必ずそうしてください」という意味します。"be sure to" 又は "please be sure to" は "make sure you" より丁寧に伝わりますので、部下への命令のような指示であれば "make sure you" は一番良いだと思います。
make sure you 〜 ; be sure to 〜 = 必ず(〜して)ください
if 〜 don't match = 合わなかったら
immediately; right away = すぐ
superior; boss = 上司