このような場面では、 "just"(ちょうど、今しがた) や "just now"(たった今、ちょうど今) を使うと良いでしょう。
日常では "Did you 〜?" を "You 〜?" という形で聞くことがよくあります。
「起きる」は "wake up"(目が覚める、目を覚ます) と "get up"(起き上がる、起床する) の2通りあるので、状況によって使い分けましょう。
"You just made this dish?"(今、この料理作ったの？)
"You called him just now?"(今、彼に電話かけたの？)
イギリス英語では、このシチュエーションで現在完了形を使います。つまり、「Have you just ＋過去分詞?」というパターンを使います。（アメリカ英語では単純な過去形で大丈夫です！）
「今、起きたの？」＝「Have you just woken/got up?」
「今、帰ってきたの？」＝「Have you just got in?/Have you just got home?」
料理や電話の場合、もう既に終わった事なので過去形を使います。
「今、（この料理）作ったの？」＝「Did you make this?」
「今、（あの人に電話）かけたの？」＝「Did you just call/ring him/her?」
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