Please let me sort out my work first.
まずは業務を整理させてください。
sort out:~をまとめる、~の体制を整える、組織化する
"sort"には選別する、区別するというような意味もありますが、
ご質問いただいた文脈ですとこのような表現でもマッチするかなと思います。
Could I have some time to organize my task first?
まずは業務を整理する時間をいただけますか?
ちょっと遠回りですが上記よりも丁寧な言い方です。
organize:整理する、整える