I'm sorry, our computer system has changed and it doesn't allow us to accept your things.
ITの人がよく「system」だけを使いますが、はっきり言うために「computer system」の方がいいと思います。Computer以外のsystemもあるよで。
「we can't accept your things」より「the computer system doesn't allow us to accept your things」の方がいいと思います。日本人は「できない」だけ言われたら「はい、わかりました」と言いますが、アメリカ人とかにはもっとはっきりの説明を伝えた方がいいです。システムのせいにした方がいいです!