You're talking about (something that's been going on) recently?
You mean, recently?
あなたが言いたい文は単に「You mean, recently?」になります。とてもカジュアルです。
「You're saying this has been happening recently?」は日常会話で言えます。
問題がまだ続けているので、「have + been」, 「have + been + -ing」の動詞の時制を使いましょう。