音や匂いが気になると言う場合、音や匂いが気に障るということだと思うので、下のように言えると思います。
1) That sound bothers me.
「音が気になる。」
That smell bothers me.
「匂いが気になる。」
bother で「悩ます」という意味があります。
2) I don't like that smell.
「あの匂いが気に入らない。」
I don't like that sound.
「あの音が気に入らない。」
ご参考になれば幸いです！
「sound」と「noise」はほぼ同じ意味ですが、「noise」のほうが「うるさい」とか「突然」とか「めんどくさい」などの感じがあります。
「～ is getting on my nerves」や「～ is getting on my last nerve」は「～が気になる」の英語の言い方であり、「超むかつく」と言う感じです。その代わりに、失礼なことを言いたくないので本当の言いたいことを直接言わないために、「What’s that smell?」とか「What’s that noise?」と言えます。
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