get sick で「病気になる」
1) I thought I was fine but I ended up getting sick.
「自分は大丈夫だと思っていたけど、病気になってしまった。」
end up 動詞のing で「最後には〜になる・結局〜になる」
2) I didn't think I would get sick but I did.
「病気になるとは思わなかったけど、なっちゃった。」
I didn't think I would ~ で「〜とは思わなかった」
ご参考になれば幸いです!