I didn't know you were leaving today.
「今日発つなんて知らなかった」
日本にいるのなら、わざわざJapanは言わなくても大丈夫です。
残念な気持ちを伝えるには、
Why didn't you tell me!?
「どうして教えてくれなかったの！？」
I wish you had told me earlier.
「もっと早く言ってくれてたらよかったのにな」
などと表現できます。
ご参考になれば幸いです。
I didn't know you were leaving Japan today.
あなたが今日、日本を出発するとは知りませんでした。
上記のように英語で表現することができます。
I didn't know that ... は「〜とは知りませんでした」という意味の英語表現です。
お役に立てれば嬉しいです。
またいつでも質問してください。
日本 
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