The starting salary is low, but depending on your performance it'll go up
質問者様のお求めの英語は:「The starting salary is low, but depending on your performance it'll go up, so good luck」になります。
「starting salary」は初給のことです。
なぜ「wages」(時給)の代わりに「starting salary」を使ったかと言うと、上がる前提であるためです。
また、頑張ってねは「good luck」が良いと思います。他にも「work hard」とか「try your best」を使えます。
それでも、なんの評価基準を使うのか明らかにすると相手も納得するのではないかと思います。
You might think your hourly wage is low now, but depending on how you work, it should go up after a while, so just keep working hard.
この場合、次のような言い方ができますよ。
ーYou might think your hourly wage is low now, but depending on how you work, it should go up after a while, so just keep working hard.
「時給が低いと思うかもしれないけど、働きぶりによってしばらくしたら上がるから、頑張って」
hourly wage「時給」
to keep working hard で「一生懸命働き続ける」=「頑張って働き続ける」
ご参考まで!