現在完了形の
Where have you been on a business trip?
をお勧めします。
Where did you go on a business trip?
「出張でどこに行ったのですか?」
という過去形は、過去の出張ならすべて対象になります。
たしかに、出張から帰ったばかりの人に対して言うなら、過去形でもその(最近の)出張のことだとわかる、という意味では、通じないことはありません。
しかし、
現在完了形の
Where have you been on business trip?
であれば、帰ってきた人に「今までどこに?」と尋ねていることが明らかなので、こちらの方が適切です。
It seemed like you were away on business. Where were you?
この場合、次のような言い方ができますよ。
ーWhere did you go on your business trip?
「出張でどこに行っていたのですか?」
ーWhere did you do business?
「どこでビジネスを行なっていたのですか?」=「どこに出張に行っていたのですか?」
ーIt seemed like you were away on business. Where were you?
「出張してたみたいだけど、どこにいたの?」=「どこに出張に行っていたのですか?」
ご参考まで!