I'm sorry I can't satisfactorily answer your inquiry that you took the trouble to make.
せっかく take the trouble to ~/take the time to ~
お問い合わせ inquiry
申し訳ない I'm sorry
この場合で「せっかく」は take the trouble to ~/take the time to ~ で表現すればいいと思います。
これは(わざわざ何かをする)という意味で、このシチュエイションに問い合わせをした人に対して、自分の謝りたい感じを表現できます。
参考になれば幸いです。