So what? は「それがどうした?」や「だから何?」という意味です。
So? だけでも似ていて、「だから?」「それが?」と言ったニュアンスとなります。
What's your point? だとどちらかと言えば「それで何が言いたいの?」「だから何?」「それで言いたいことは?」という感じです。
例:
Don't you think that lesson was a bit strange? (さっきのレッスンちょっとおかしくなかった?)
Yeah, So what? / What's your point? (そうね、それがどうした?)