in three months
three months later
after three months
上記のどれを用いても、『3カ月後』という意味になります。
違いを言うのであれば、in three monthsとafter three monthsは、前置詞inもしくは前置詞afterを伴った、前置詞句となりますが、three months laterは副詞句になります。
『3か月後に大事な試験がある。』
I have an important exam in three months.
『3カ月たったら、彼に連絡しよう。』
After three months, I will contact him.
『私は3か月後に26歳になります。』
I will be twenty-six years old three months later.