Wait は「待つ」という意味ですが、この場合は 「ちょっと待って。。。」と考える時に使います。「あれ?」のような一旦わからなくなって考える感じです。他にも Hold on... とか Wait a second / Hold on a second (直訳:1秒待って)とも言います。
Why did I come back here again? は「何でまたこっちに戻ってきたんだっけ?」という意味です。
ちなみに I can't remember why I came here というと「何でここにきたのか思い出せない」となります。どうぞご参考に。