ーI didn't mean anything bad by that.
「悪い意味で言ってないです。」
I didn't mean anything sexual by that. と言うと
「性的な意味で言ってないです。」となります。
mean by ... で「…を意味する・…の意味で言う」
ーI don't mean that in a weird way.
「変な意味じゃないです。」
I don't mean that in a sexual way. と言うと
「性的な意味じゃないです。」となります。
weird で「変な・妙な」
ご参考まで!