この場合「体がほぐれる」は
your back will loosen up のように言えます。
your body will loosen up とも言えますが、もう少し詳しく体の部分を絞って言った方が自然かもしれません。
例:
If you keep stretching, I'm sure your back will loosen up eventually.
「ストレッチを続ければ、そのうち腰がほぐれてくるよ。」
If you keep moving, the muscles in your back will relax after a while.
「動いていたら、そのうち腰の筋肉がほぐれてくるよ。」
the muscles in your ... will relax という言い方もできます。
ご参考まで!