Customers sit with an empty seat/table in between them.
こんにちは。
様々な表現があると思いますが、例えば下記のように言うことができます:
・Customers sit with an empty seat/table in between them.
「お客さんは間に空席/テーブルを一つ挟んで座ります」
他には下記のような表現も便利かもしれません:
・We can't sit too close to each other to maintain social distance.
「ソーシャルディスタンスを保つためにお互い近すぎるところには座れません」
ぜひ参考にしてください。