There are days when we have classes only in the mornings, as well as days when we have classes in the afternoons.
"There are days"=「そのような日々がある」
"when we have classes only in the mornings"=「午前中だけに授業がある日」
"as well as days when we have classes in the afternoons."=「午後にも授業がある日々も」
☆↑の文章だと授業は午前の授業ではなく、午後だけ授業がある、という意味と思われるかもしれないので、"as well as when we have classes in the mornings and afternoons."(午前と午後に授業がある日々)という言い方のほうが良いかもしれません。