一番シンプルに「え、それだけ?」なら「What? That's it?(またはThat's all?)」でいいと思います。
この回答に「え、それだけ?」と言われてしまいそうですが(笑)、実際に北米に住んでいて普通に使う言い方です。
「That's it.」は、語尾をあげずに肯定の意味で使えば「それで終わり」とか「それだけだよ」ということになります。語尾をあげて疑問として使えば、「それだけなの?それでおしまい?」とか聞いているわけですね。
少し違った表現をしたければ
「Really? Is that all you have for your regular breakfast?」(本当に?ふだん朝食に食べるのってそれで全部なんですか?)
とかも良いですね。
参考にしていただければ幸いです。