５時までに作業が終わってくれるなら、いつその作業を始めても構いません。って英語でなんて言うの？

念のため直訳を先にお示しします。「あなたがそれを5時までに終わらせるのなら、あなたはその仕事をいつでも始められます」

　この英文でポイントになる部分を以下にご紹介します。

・can
　この英文の場合には「〜できる」という意味ではなく「〜してもよい」という意味で使っています。もちろん元々の意味は「〜できる」なので、日本語にしようとすると文脈によって訳し方が変わります。

・as long as ...
　この表現は「…である限り」といういう意味です。そしてこの表現を使うときには注意が1つあります。文法書などではよく「時や条件を表す副詞節」として、この as long as ... が紹介されていますが、この副詞節の中では内容が未来でも現在形を使うというルールがあります。
　そのため、この文を発言する時点から見て5時は未来のことであるはずですが、will や be going to などは使われていません。
　この理由は、「〜のとき」「〜であれば」「〜の限り」のような表現は、実際にいつするのかということに関係なく、「〜のとき、〜の条件のときには」のように場面設定をしているからです。つまりすることを前提にしているんですね。たとえばもし will を入れてしまうと「〜だろう」という推測の意味が入ってしまい、場面設定にはなりません。

例）I'll go shopping if he comes home by 3.「彼が3時までに帰ってくるのなら（場面設定）、私は買い物に行くだろう」
　We will start cooking when you come home.「あなたが家に帰ってきたら、私たちは料理を始めます」

※注意　I don't know when he will come home. 「私は彼がいつ家に帰ってくるか分からない」
　この場合は場面設定ではなく、未来の事柄について知らないと言っている。

　以上で解説は終わりですが、お役に立ちましたでしょうか。

As long as you finish by five, I don't mind when you start working＝五時にさえ終われば、何時に作業を開始しても構いません

As long as＝〜であれば、〜でさえあれば

I don't mind＝（私は）構わない