Thank you for having me during this difficult time.
I'm sure you'll get through this one way or the other.
いろいろな言い方ができると思いますが、次のような表現はどうでしょうか？
同情の気持ちを示す場合：
ーI'm sure this must be a hard time for you.
「あなたにとって大変な時に違いない」
感謝の気持ちを示す場合：
ーThank you for having me during this difficult time.
「大変な時なのに私を住まわせてくれてありがとう」
励ましの気持ちを示す場合：
ーI'm sure you'll get through this one way or the other.
「あなたならなんとかして乗り越えられると思います」
ご参考まで！
I'm very sorry for what you're going through. If there's anything I can do to help, please let me know.
ご質問ありがとうございます。
この場面で英語で「I'm very sorry for what you're going through. If there's anything I can do to help, please let me know.」と言えます。
最初の「I'm very sorry for what you're going through.」は相手は辛いのとき、サポート言葉として使えます。
同じようにサポートや励む言葉として「If there's anything I can do to help, please let me know.」でも言えます。
ご参考になれば幸いです。
カナダ 
アメリカ合衆国 
