お好みでどうぞって英語でなんて言うの？

「好みに応じて」という意味であれば as you like、「それが好きであれば」という意味であれば、if you like になります。「薬味など」とのことですが、1種類であれば、it（または this）複数あれば them（または these）になります。

Please put/use/sprinkle this as you like. 好みでつけてください。 put〜, use, sprinkleは少しずつニュアンスが違いますが、 「薬味をのせる」というこちらのシチュエーションでしたらどれも使えます。 "sprinkle"はふりかけるという意味で（日本語で言うスプリンクラーをイメージしてもらうとわかりやすいと思いますが）粉末や液体などに使えます。

お好みで入れてください、と言いたいので Please put this 〇〇 if you like. お好みでこの〇〇をいれてください、という意味になります。