Self-employedは厳密にいうと、会社経営者についても使えますね。
見た限りでは具体的にどんな自営業、どんな会社を経営しているかを書いておくことが多いです。
Her mother is a freelance graphic designer, and her father is the owner of a real estate company
(例えば女の子の)母親が自営業(フリーランスのグラフィックデザイナー)で、父親が不動産の会社経営をしております。
は自然に感じます。
ご参考になれば幸いです。