Thank you for understanding me all the time. I'm so happy to be your friend.
本当に、仲良くしてくれる親友に向けての言葉だと思ったので、少し追加してみました。
Thank you for understanding me all the time.
「いつも私の事を理解してくれてありがとう」
all the time
に「いつも」という意味が含まれています。
最後にお礼のような感想を入れると、きっと気持ちが素直に伝わると思います。
I'm so happy to be your friend/
「私はあなたの友達になれてうれしいです。」
ご参考になれば幸いです。