45,000円を工事費として弊社に請求してくださいって英語でなんて言うの？

請求書＝invoce 工事費＝expenses for construction work で、弊社をour company とするか、my company とするかは、工事の場所などによって微妙に変わってきますが、 Please send an invoice of the expenses for construction work 45,000 yen to our company. で、問題なく通じます。

Please invoice our company for 45,000 yen as construction fees. 請求する＝invoice 工事費＝construction fee invoiceを名詞として使用することが多いかと思いますが、動詞として使うこともできますのでバリエーションの一つとして覚えておくといいと思います。